Em um futuro distante, os seres humanos não habitam mais a Terra. A causa do desaparecimento (ou até mesmo da morte) deles é desconhecida, mas essa ausência deixou um vazio pronto para ser preenchido por outra espécie senciente.

Ao longo de inúmeras gerações, uma espécie da humilde abelha evoluiu para preencher essa lacuna. A espécie ficou cada vez maior e mais inteligente até se tornar uma sociedade altamente avançada. Elas se chamam Melíferas.

Em Apiary, cada jogador controla 1 das 20 facções únicas. Sua facção começa a partida com suprimentos escassos: uma colmeia, alguns recursos e abelhas operárias. Um desafio de alocação de operárias e construção de colmeias está à sua espera: explore planetas, colete recursos, desenvolva tecnologias e crie esculturas para mostrar quais são os pontos fortes da sua facção.